2006 年我國政府欲與巴布亞紐幾內亞建交。國安會秘書長邱義仁因為國防部副部長柯承亨的介紹，認識商人金紀玖與吳思材，邱義仁將金吳兩人介紹給外交部長黃志芳最後並未建交，但掮客不願歸還秘密外交經費。
這筆秘密援助巴紐的經費，共計美金三千萬元，居中牽線的兩位商人要求其中的美金二十萬元，作為「活動費」，並匯入金吳兩人在新加坡開立的聯名帳戶。就在外交部長黃志芳與巴紐代表團即將簽署建交公報之際，黃部長發現對方並非正式外交官，手上僅有總理的授權書，內情恐不單純，因此拒簽建交公報。然而金吳兩人不願退還這筆鉅款，金紀玖後來趁機潛逃美國。
據媒體披露，金紀玖是善於鑽營的商人，與藍綠陣營都交好，因為取得我國政府官員的信任，成為台灣與巴紐建立建交管道的掮客。由於這筆美金三千萬元的鉅款，來自外交部的機密預算，立法院無法進行實質審查，而審計部審查決算時，也看不到經費流向，缺乏嚴謹的經費把關機制。
2008 年 5 月，時任行政院副院長的邱義仁與外交部長黃志芳、國防部副部長柯承亨等三位閣員，為了負起政治責任請辭獲准。2010 年，新加玻法院宣判金紀玖必須歸還我國政府存入私人帳戶的巴紐案款項。
我外交爆超大醜聞2006 年擬與巴紐建交 九億台幣遭侵吞
2008-05-02/聯合報/A1版/要聞
【記者盧德允╱台北報導】
民進黨政府即將交出政權之際，爆發外交超級大醜聞。外交人士透露，由扁政府高層邱義仁牽線，外交部二○○六年委託中間人金紀玖和吳思材與巴布亞紐幾內亞談判建交，秘密援助經費兩千九百八十萬美元（約台幣八億九千四百萬元），結果全遭侵吞。
外交部已經在新加坡委託律師追討，並將本案送檢調單位偵辦。中央社報導，擁有美國護照的金紀玖去向不明，而吳思材則已被台灣司法單位扣留，正進一步調查中。
中間人 邱義仁介紹的
外交界資深人士指出，這件外交部試圖與巴紐建交的案子，是邱義仁起的頭。邱介紹金紀玖和吳思材給外交部，由兩人居中與巴紐談，並要求三千萬美元秘密經費，其中廿萬美元是金和吳的活動費。
外交部二○○六年八月與金紀玖、吳思材達成口頭協議，委託兩人擔任中間人，與巴布亞紐幾內亞談建交，並同意存入三千萬美元到兩人於新加坡華僑銀行設立的聯名戶頭，作為給巴國技術援助經費。
雙方約定，金、吳兩人承諾僅在外交部同意及技術援助談判成功後，才能從戶頭提款。兩人也同意，如果外交部提出要求，就必須無條件返還這筆款項。
討鉅款 兩人都拒歸還
同年九月十四日外交部把兩千九百八十萬美元匯入金紀玖、吳思材在新加坡華僑銀行的聯名戶頭。吳通知外交部收到匯款，並寫信給外交部長黃志芳，確認協議條款。
外交部後來決定中止與巴布亞紐幾內亞的談判，並於二??六年底向金紀玖、吳思材追討款項。但兩人並未歸還鉅款，於是外交部在新加坡提出訴訟，要求兩人歸還這筆款項，同時支付訴訟費用。
據了解，外交部四月十八日透過呂俊昭律師事務所，向新加坡高等法院控告金紀玖和吳思材，要求追討屬於中華民國政府的兩千九百八十萬美元。
星法官 裁准凍結資產
為防止金紀玖和吳思材脫產，外交部又於四月廿八日透過律師，向新加坡高等法院申請禁制令，要求在訴訟開審前，禁止金、吳脫手或處理在新加坡的資產，禁制令適用於他們在新加坡的資產，無論資產是否在他們名下，以及獨立或聯名擁有，承審法官洪素燕已裁准。
禁制令規定他們必須在收到法院命令廿一天內，向外交部委託律師交代在新加坡的資產。
外交部發言人葉非比昨天指出，台灣外交處境艱困，推動秘密外交有其必要，本案現已進入司法程序，且為保護國家利益等實務考量，詳細內情目前不便對外說明。